黿屬于國家一級水生野生保護(hù)動物，資源瀕危。珠江所龜鱉遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)自從2014年在全國率先成功開展黿人工繁育以來，積極開展黿保護(hù)生物學(xué)研究，擴(kuò)大人工保種數(shù)量，不斷推進(jìn)黿拯救行動計(jì)劃，為該物種野外種群恢復(fù)奠定了夯實(shí)的物質(zhì)和技術(shù)基礎(chǔ)。

近日，龜鱉遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在黿保護(hù)生物學(xué)研究方面取得重要進(jìn)展，團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了黿染色體水平上的基因組精細(xì)圖譜，在基因組水平上發(fā)現(xiàn)了與腫瘤抑制、生長和年齡相關(guān)基因候選基因發(fā)生了擴(kuò)張，進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)龜鱉的RSCU值相較于其它脊椎動物處于中間水平。基于建立的黿參考基因組，構(gòu)建了冬眠前后外周血單細(xì)胞圖譜，發(fā)現(xiàn)并區(qū)分了正常狀態(tài)和休眠期的細(xì)胞類型，為每個(gè)細(xì)胞亞群識別了一系列標(biāo)記基因，確定了與應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)的基因，為更好地解析冬眠的適應(yīng)機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。針對黿野外資源調(diào)查困難的現(xiàn)狀，開發(fā)了基于線粒體ND5基因的黿環(huán)境DNA檢測技術(shù)，并在野外水域得到了應(yīng)用，為黿野外資源調(diào)查和放流效果評估提供了新的思路和輔助方法。圍繞以姿勢-動作-環(huán)境為中心，以生態(tài)功能為依據(jù)，構(gòu)建并開展了人工培育下幼黿的PAE行為譜等方面的行為學(xué)研究。系列研究為深入開展黿保護(hù)生物學(xué)研究奠定了理論基礎(chǔ)，為人工馴養(yǎng)管理及放流提供技術(shù)支撐。

相關(guān)研究成果以5篇論文的形式呈現(xiàn)。分別為“A chromosome-level genome assembly of the Asian giant softshell turtlePelochelys cantorii”發(fā)表于Scientific data, 2023, 10:754 (IF=9.8, JCR1區(qū))，洪孝友助理研究員為第一作者，朱新平研究員和劉曉莉助理研究員為共同通訊作者；“Single-cell atlas reveals the hemocyte subpopulations and stress responses in Asian giant softshell turtle during hibernation”發(fā)表于Biology, 2023, 12:994 (IF=4.2, JCR2區(qū))，洪孝友為第一作者，朱新平和劉曉莉?yàn)楣餐ㄓ嵶髡撸弧癈hromosome-level analysis of thePelochelys cantoriigenome provides insights to its immunity, growth and longevity”發(fā)表于Biology, 2023, 12:939 (IF=4.2, JCR2區(qū))，劉曉莉?yàn)榈谝蛔髡撸煨缕胶秃樾⒂褳楣餐ㄓ嵶髡撸弧癊xploring the relationship between environmental DNA concentration and biomass in Asian giant softshell turtle (Pelochelys cantorii)”發(fā)表于PeerJ, 2023, 11:e16218 (IF=2.7, JCR2區(qū))，洪孝友和研究生王開闊為第一作者，朱新平為通訊作者；“Behavior coding and ethogram of juvenile domesticated Asiangiant softshell turtles,Pelochelys cantorii”發(fā)表于Russian Journal of Herpetology, 2023, 30(3) (IF=0.7, JCR4區(qū))，洪孝友為第一作者，朱新平為通訊作者。上述研究成果得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃藍(lán)色糧倉重點(diǎn)專項(xiàng)、中國-東盟聯(lián)合基金、廣東省自然基金面上項(xiàng)目、廣州市科技計(jì)劃重點(diǎn)項(xiàng)目、中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部政府購買服務(wù)項(xiàng)目和廣東農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳一般性轉(zhuǎn)移項(xiàng)目等的資助。

圖1黿染色體水平基因組情況

圖2黿的外周血細(xì)胞冬眠前后的單細(xì)胞圖譜

圖3不同地區(qū)黿ND5引物擴(kuò)增片段與對比

圖4幼黿捕食行為