2005年度日本水產廳調整組織結構及成員的具體情況包括以下幾點：一是設置水產貿易業務及加工流通課水產貿易對策室等；二是重新規劃漁船保險及漁業互助業務，撤消漁業保險課下設的漁業保險監理官；三是加強建設行政組合辦公體制，設置水產經營課協同組合指導官；四是整頓漁業救災體制，在防災漁村課設置水產施設災害對策室；五是完善漁業調整事務所的資源管理體制，設置資源課、漁業監督課，增加漁業監督指導官。本次水產廳結構調整共增加員工17人，目前員工總數已達到970人。