近日，由黑龍江所梁利群研究員主持的“魚類耐鹽堿性狀轉(zhuǎn)錄組測序研究”課題組采用羅氏454測序平臺，分別完成了堿水、淡水雅羅魚鰓、腎組織的轉(zhuǎn)錄組表達差異研究。

研究中測序共得到1,826,022條序列，其中有效序列1,683,616條，平均長度298bp。序列經(jīng)Newbler軟件拼接得到30,606個contigs，平均長度為1,022bp。蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫比對發(fā)現(xiàn)，19,196個contigs具有明確的生物學(xué)功能，與斑馬魚匹配的同源蛋白多達16，000條；數(shù)字差異表達譜分析顯示，共有2247個基因在堿水、淡水雅羅魚的鰓、腎組織中發(fā)生顯著變化，其中在堿水中上調(diào)基因1049個，下調(diào)基因1198個。目前測序數(shù)據(jù)的初步分析、整理工作已接近尾聲，數(shù)據(jù)深度挖掘工作正在有序進行中。

本項研究工作對揭示魚類耐鹽堿機理、培育性狀優(yōu)良的魚類耐鹽堿新品種，具有十分重要的科學(xué)意義。