日前,中國水產科學研究院長江水產研究所范玉頂博士為第一作者、曾令兵研究員為通訊作者的研究論文“Identification and genomic characterization of a novel fish reovirus, Hubei grass carp disease reovirus, isolated in 2009 in China”(2013,94:2266-2277)在病毒學國際權威期刊《普通病毒學雜志》(《Journal of General Virology》)刊登。該期刊2012年影響因子為3.127。
論文詳細介紹了長江所關于一株新的草魚呼腸孤病毒分離、鑒定的最新研究成果。論文闡述了長江所科研人員在患出血病草魚體內分離到了一株新呼腸孤病毒HGDRV (Hubei grass carp disease reovirus, 原名GCRV104),并利用國際先進水平的基因組克隆技術“FLAC技術”測定了該病毒的全基因組序列。HGDRV 全基因組大小為23706 bp,由11條(S1-S11)分節段的dsRNA組成,共編碼12種蛋白(S11編碼兩種蛋白),其中7條片段(S1-S6,S8)編碼的蛋白和已知水生呼腸孤病毒同源蛋白的相似性在15–46%之間,而另外4個片段(S7、S9、S10、S11)編碼的蛋白經過Blastp檢索沒有發現同源蛋白。論文還通過全基因組數據的比對分析,證實HGDRV不同于任何已分離到的水生呼腸孤病毒,應為水生呼腸孤病毒屬(Aquareovirus)的一個新種。
HGDRV基因組自2012年4月公布以來,引起了國內外病毒學家的極大興趣。短短一年時間,中國、美國、加拿大等國的研究人員就引用了HGDRV的基因組數據并將文章發表在《Journal of Virology》、《PLOS ONE》、《Virology Journal》等著名雜志上。同時,HGDRV的分離鑒定也更新了我國草魚呼腸孤病毒基因分型系統,使草魚呼腸孤病毒基因分型由原來的兩個型(Ⅰ、Ⅱ)增加到現在的三個型(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),而HGDRV是目前Ⅲ型的唯一代表株。此外,范玉頂博士還利用FLAC技術獲得了另外4株我國不同地區草魚呼腸孤病毒典型代表株的全基因組序列,使Genbank數據庫中可查詢到的水生呼腸孤病毒全基因組序列由原來的6株增加為現在的11株。
由草魚呼腸孤病毒引起的草魚出血病一直是危害我國草魚健康養殖最為嚴重病毒性疾病。目前,草魚出血病仍無有效的治療藥物,最為有效的辦法是免疫預防。論文發現了草魚呼腸孤病毒的新的株型,豐富了水生呼腸孤病毒基因組資源,有利于進一步研究病毒的遺傳進化、致病機理,同時對研究與開發具普遍保護性的廣譜疫苗具有重要的理論意義和應用價值。