近日，中國水產科學研究院鱖鱸基因組學與選擇技術創新團隊聯合華大海洋在大口黑鱸遺傳育種研究上取得新進展，研究論文“Whole-genome resequencing reveals recent signatures of selection in five populations of largemouth bass (Micropterus salmoides)”發表在TOP期刊《Zoological Research》（IF6.975，Q1）上。文章首次開展大口黑鱸遺傳選育對基因組層面的影響研究，通過對五個群體的群體結構、親緣關系與選擇信號的比較分析，探索遺傳改良的印跡。該研究受廣東省重點領域研發計劃項目、現代農業產業技術體系建設專項（CARS-46）和水科院科技創新團隊項目等的支持。孫成飛副研究員和張新輝博士為論文共同第一作者，葉星研究員和石瓊研究員為論文共同通訊作者。

大口黑鱸原產于北美洲。20世紀70年代末中國臺灣從美國引進并于1983年人工繁殖獲得成功，同年從臺灣引入廣東省，隨后在中國多個省市與地區推廣養殖。因此大口黑鱸經歷了從美國野生群體到臺灣養殖群體，再到中國大陸的逐步馴化與繁養殖，以及隨后經選擇育種形成多個選育群體的過程。近年來團隊與廣東佛山新榮水產有限公司合作，經過連續5代的選育培育了“加得豐”鱸新品系，選育效果明顯。為了破譯大口黑鱸馴化的遺傳基礎，了解定向選擇對物種基因組產生的影響，本研究對5個大口黑鱸群體，包括美國的野生群體、中國臺灣養殖群體、中國大陸馴養與選育群體（加得豐選育群體、優鱸選育群體和普通養殖群體）進行基因組重測序、群體遺傳學分析和選擇信號定位分析。LD（連鎖不平衡）和遺傳多樣性分析結果表明，中國大陸4個群體經歷了更嚴格的遺傳選擇。通過選擇性信號分析，在大口黑鱸基因組中確定了數百個選擇性信號區域，并從中篩選到103個相關基因，其中有多個基因與生長（如psst1和grb10）、早期發育（klf9、sp4和sp8）和免疫（pkn2、sept2、bcl6和ripk2等）相關。本研究提供了大口黑鱸在全基因組水平上的遺傳變異和選擇信號，為深入了解遺傳改良的分子機制提供了新見解，同時為大口黑鱸重要經濟性狀的進一步改良提供理論依據。

文章鏈接：https://www.zoores.ac.cn/en/article/doi/10.24272/j.issn.2095-8137.2022.274

  大口黑鱸基因組部分受選擇的區域及相關基因