近日，中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)、淡水漁業(yè)研究中心“長(zhǎng)江特色水生動(dòng)物繁養(yǎng)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)”在淡水螺類(lèi)遺傳與苗種繁育研究方面取得新進(jìn)展。

梨形環(huán)棱螺（B. purificata）俗稱(chēng)螺螄、石螺、豆田螺、湖螺，是環(huán)棱螺屬中個(gè)體最大的種，具有分布廣、用途多的優(yōu)點(diǎn)，既是中華絨螯蟹、中華鱉、青魚(yú)等優(yōu)質(zhì)水產(chǎn)品的重要天然餌料，也是特色水產(chǎn)品寬體金線(xiàn)蛭的唯一餌料來(lái)源，更是廣大市民“菜籃子”工程的重要組成部分之一。作為柳州螺螄粉重要原料之一，梨形環(huán)棱螺的短缺一定程度上也限制了地方特色產(chǎn)業(yè)的快速發(fā)展。此外，在淡水水域生態(tài)系統(tǒng)中，梨形環(huán)棱螺對(duì)維持淡水水生態(tài)系統(tǒng)平衡同樣具有不可替代的作用。

自2015年起，團(tuán)隊(duì)圍繞梨形環(huán)棱螺群體遺傳學(xué)、選擇育種、池塘一級(jí)凈化區(qū)不投餌養(yǎng)殖和“稻螺共作”等生產(chǎn)方式及水產(chǎn)品加工領(lǐng)域開(kāi)展了系列研究，為梨形環(huán)棱螺規(guī)模化繁養(yǎng)積累了一系列解決方案。

為了進(jìn)一步挖掘梨形環(huán)棱螺種質(zhì)資源，團(tuán)隊(duì)通過(guò)PacBio測(cè)序和Hi-C技術(shù)組裝獲得了首個(gè)梨形環(huán)棱螺染色體水平基因組，共產(chǎn)生了33.64Gb的環(huán)形一致性序列。初步組裝的梨形環(huán)棱螺基因組大小為1.01Gb，Contig N50長(zhǎng)45.14Mb。通過(guò)Hi-C技術(shù)的糾錯(cuò)，最終得到984.33Mb大小的梨形環(huán)棱螺基因組，Contig N50長(zhǎng)37.21Mb，scaffold N50長(zhǎng)141.97 Mb，并將99.28%的基因組序列錨定到8條染色體上，共預(yù)測(cè)了22125個(gè)蛋白編碼基因。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明：梨形環(huán)棱螺與福壽螺大約在2.88億年前產(chǎn)生分化；比較基因組分析表明：梨形環(huán)棱螺中有34個(gè)基因家族發(fā)生擴(kuò)張，26個(gè)基因家族發(fā)生收縮，4個(gè)蛋白編碼的基因被正選擇（FDR<0.05）。該研究為進(jìn)一步探究淡水螺類(lèi)的生態(tài)學(xué)、進(jìn)化及選擇育種提供了重要的基因組資源。

相關(guān)研究論文“Chromosome-level genome assembly of the freshwater snail Bellamya purificata (Caenogastropoda)”在線(xiàn)發(fā)表于JCR一區(qū)期刊《Zoological Research》（IF=6.975）上。淡水中心水產(chǎn)養(yǎng)殖研究室金武博士、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院曹小娟副教授為共同第一作者，徐東坡研究員和聞海波研究員為共同通訊作者。全文網(wǎng)址：https://www.zoores.ac.cn/en/article/doi/10.24272/j.issn.2095-8137.2022.118

本研究得到了水科院基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)（2021XT703）和淡水中心基本業(yè)務(wù)費(fèi)（2021JBFM07）資助。