日前,中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院長(zhǎng)江水產(chǎn)研究所鄒桂偉研究員牽頭的鰱鱔遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在長(zhǎng)豐鰱低氧脅迫下的分子響應(yīng)機(jī)制解析方面取得新進(jìn)展。團(tuán)隊(duì)圍繞長(zhǎng)豐鰱耐低氧優(yōu)良性狀形成的分子基礎(chǔ),通過(guò)組織學(xué)、生理生化及蛋白組和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,揭示了低氧脅迫下長(zhǎng)豐鰱不同組織的生理響應(yīng),并篩選鑒定出了對(duì)低氧顯著應(yīng)答的蛋白和分子信號(hào)通路。
團(tuán)隊(duì)研究發(fā)現(xiàn),肝臟作為重要的代謝和能量供給器官,在急性低氧脅迫下,主要以糖酵解和氨基酸代謝進(jìn)行供能。在此過(guò)程中,分別篩選鑒定到42個(gè)、13個(gè)和19個(gè)差異蛋白,主要在肝臟細(xì)胞骨架合成、細(xì)胞內(nèi)氧化應(yīng)激和鐵死亡、免疫防御相關(guān)過(guò)程中發(fā)揮應(yīng)答作用,對(duì)于維持肝臟正常生理功能具有重要作用(Li et al., Antioxidants, 2022)。腦作為生命機(jī)能的主要調(diào)節(jié)器,低氧脅迫下,腦中參與神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育的neurotransmitter transport、neurotransmitter:sodium symporter activity等GO term顯著富集。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),腦內(nèi)生長(zhǎng)激素抑制素(SST1A)含量升高,推測(cè)可能是造成魚(yú)類低氧下生長(zhǎng)減緩的原因之一;多巴胺降解酶(COMT)含量降低,可能導(dǎo)致多巴胺積累,進(jìn)而造成性腺發(fā)育遲緩(Li et al., Antioxidants, 2022;Feng et al., Comp. Biochem. Physiol. Part D Genom. Proteom., 2022)。

圖1 蛋白組學(xué)分析低氧-復(fù)氧脅迫下鰱肝臟與腦的損傷
團(tuán)隊(duì)對(duì)不同程度低氧脅迫下的心臟組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,獲得低氧脅迫下最顯著富集的PI3K-Akt signaling pathway、FoxO signaling pathway和 JAK-STAT signaling pathway三個(gè)KEGG信號(hào)通路,并利用DDIT4、EGLN、FOXO1、PEPCK、HIF-1α等20個(gè)顯著差異表達(dá)基因繪制出糖酵解、血管生成、抗凋亡、氧化應(yīng)激、細(xì)胞自噬等應(yīng)答反應(yīng)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖,進(jìn)而闡明心臟組織應(yīng)對(duì)低氧脅迫的響應(yīng)機(jī)制(Li et al., Comp. Biochem. Physiol. Part D Genom. Proteom., 2021)。

圖2 轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析鰱心臟應(yīng)對(duì)低氧脅迫的生理和分子響應(yīng)
團(tuán)隊(duì)在不同程度低氧脅迫下,共鑒定出與低氧脅迫相關(guān)的已知miRNA 299個(gè)、新miRNA 391個(gè),預(yù)測(cè)差異miRNA的靶基因并通過(guò)實(shí)驗(yàn)證實(shí)了miR-17a-5p與低氧脅迫的明星分子低氧誘導(dǎo)因子-1α(Hypoxia Inducible Factor-1α, HIF-1α)存在直接靶向關(guān)系(Wang et al., Animals, 2021),進(jìn)而分析了低氧脅迫下維持HIF-1α穩(wěn)定性的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子輔氨酰羥化酶(Prolyl Hydroxylase Domain, PHD)基因家族的分子應(yīng)答,為后續(xù)開(kāi)展鰱耐低氧新品種的選育提供了一定的理論依據(jù)(Li et al., Animals, 2022)。
長(zhǎng)豐鰱是長(zhǎng)江所采用人工雌核發(fā)育、群體選育和分子標(biāo)記輔助選擇相結(jié)合的綜合育種技術(shù)培育出的養(yǎng)殖新品種(品種登記號(hào):GS01-001-2010),是“四大家魚(yú)”的第一個(gè)水產(chǎn)新品種,其具有耐低氧、生長(zhǎng)快、體型好、適應(yīng)性強(qiáng)等優(yōu)良性狀,適合在全國(guó)可控的淡水水體中養(yǎng)殖。該品種為國(guó)家大宗淡水魚(yú)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系推薦新品種,被農(nóng)業(yè)農(nóng)村部列為農(nóng)業(yè)主推品種,已推廣至全國(guó)27個(gè)省、市或自治區(qū),產(chǎn)生了顯著的經(jīng)濟(jì)效益、社會(huì)效益與生態(tài)效益,為廣大養(yǎng)殖企業(yè)(戶)的增產(chǎn)、增收做出了重要貢獻(xiàn)。
相關(guān)研究成果分別在《Antioxidants》(JCR1區(qū),IF 6.313)、《Animals》(JCR1區(qū),IF 2.752)、《Comparative Biochemistry and Physiology - Part D: Genomics and Proteomics》等雜志上發(fā)表。
上述研究工作得到了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(2018YFD0900302)、中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)(2020TD33)、國(guó)家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-45)、湖北洪山實(shí)驗(yàn)室開(kāi)放課題(2021hskf014)等項(xiàng)目的資助。團(tuán)隊(duì)成員李曉暉、馮翠、王巧欣分別為第一作者,鄒桂偉研究員和梁宏偉研究員為通訊作者。
相關(guān)文章鏈接分別為:
1.https://www.mdpi.com/2076-3921/11/3/589
2.https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1744117X21001635
3.https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1744117X21001209
4.https://www.mdpi.com/2076-2615/11/10/2917
5.https://www.mdpi.com/2076-2615/12/2/131